Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KIF4AO95239 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms