Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms