Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN3BO60391 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms