Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SUSD5O60279 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms