Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTATSF1O43719 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms