Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms