Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms