Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIP1O00291 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIP1O00291 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIP1O00291 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms