Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms