Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAPO00193 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAPO00193 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAPO00193 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAPO00193 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAPO00193 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAPO00193 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAPO00193 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAPO00193 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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SMAPO00193 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAPO00193 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAPO00193 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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