Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms