Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCER2I3L3R5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCER2I3L3R5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms