Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPIPB9F8W1W9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPIPB9F8W1W9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms