Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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USP27XA6NNY8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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USP27XA6NNY8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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USP27XA6NNY8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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USP27XA6NNY8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP27XA6NNY8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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USP27XA6NNY8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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USP27XA6NNY8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP27XA6NNY8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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