Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C9orf92A6NGG3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms