Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms