Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL33A6NCF5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms