Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A3GALT2U3KPV4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms