Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms