Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9Y3F1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9Y3F1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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