Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR3KQ9Y2Y1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR3KQ9Y2Y1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms