Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms