Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DTX4Q9Y2E6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms