Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FARSAQ9Y285 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms