Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SHOC2Q9UQ13 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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