Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA3Q9UL41 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms