Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms