Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIMS3Q9UJD0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RIMS3Q9UJD0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms