Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP25Q9UHP3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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