Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms