Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1L1Q9UHC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms