Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DKK2Q9UBU2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms