Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX3Q9UBR4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LHX3Q9UBR4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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