Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HCN3Q9P1Z3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms