Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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