Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM106BQ9NUM4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms