Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINM1Q9NU53 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms