Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNTG1Q9NSN8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms