Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf4Q9NR00 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C8orf4Q9NR00 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms