Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GPHNQ9NQX3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms