Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms