Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM27Q9HBJ8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM27Q9HBJ8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms