Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB1BQ9H0U4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1BQ9H0U4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms