Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM4Q9C037 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM4Q9C037 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms