Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VN1R3Q9BXE9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VN1R3Q9BXE9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms