Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PLVAPQ9BX97 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PLVAPQ9BX97 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms