Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HIGD2AQ9BW72 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms