Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHD1Q9BUP0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms