Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDC1Q9BTX1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms