Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms